GeneAtlas™ System – комплексное решение Affymetrix для анализа экспрессии генов с использованием гибридизационных чипов высокой плотности. GeneAtlas™ позволяет анализировать транскрипты практически всех известных генов множества организмов одновременно для 4-х образцов.
Система включает в себя все необходимое для проведения исследований – от комплектов реагентов и гибридизационных чипов до оборудования и комплексного программного обеспечения для обработки данных:
Гибридизационная камера;
Роботизированную станцию для отмывки и мечения флуорофором микрочипов;
Сканер микрочипов;
ПО для управления процессом обработки чипов и анализа данных.
В системе Affymetrix GeneAtlas™ System используется полностью новый формат чипов – Array strip, включающий четыре отдельных чипа. За счет этого облегчается процесс гибридизации, уменьшается объем ручных операций. Формат чипов идеально подходит для полностью автоматизированной обработки.
Для системы возможно использование кастомизированных микрочипов с количеством зондов до 1,4 млн. на чип.
Наименование |
Описание |
Affymetrix®miRNA 4.1 Array Strip |
Микрочипы для анализа микро-РНК. 100% покрытие базы данных miRBase. Более 200 организмов. |
Affymetrix Human Genome U219 Array Strip |
Самое экономичное решение для профилирования экспрессии генов человека. Тестирование только аннотированных транскриптов. Более 36 000 транскриптов и их вариантов. |
Affymetrix®Human Genome U133 Array Strip |
Микрочипы для профилирования экспрессии генов человека. Большая часть работ в мире с анализом транскриптов была сделана с использованием 133-й серии чипов Affymetrix. Количество публикаций >6000. Используется для поиска новых регуляторных путей, валидации лекарственных мишеней, понимания механизма апоптоза, анализа токсикологического ответа, поиска ключевых биомаркеров. |
Affymetrix MG-430 PM Array Strip |
Микрочипы для анализа экспрессии генов мыши. Тестирование более 39 000 транскриптов. |
Affymetrix RG-230 PM Array Strip |
Микрочипы для анализа экспрессии генов крысы. Тестирование более 30 000 транскриптов. |
Human Gene ST Array Strips |
Новый микрочип для полнотранскриптомного анализа кодирующих (mRNA) и некодирующих (lincRNA) транскриптов человека. Кол-во кодирующих >30 000, некодирующих >11 000. |
Mouse Gene ST Array Strips |
Микрочип для полнотранскриптомного анализа экспрессии генов мыши. Тестирование более 27 000 генов мыши. |
Rat Gene ST Array Strips |
Микрочип для полнотранскриптомного анализа экспрессии генов крысы. Тестирование более 28 000 генов крысы. |
Model and applied research organisms Gene 1.1 ST Array Strips |
Микрочипы для полнотранскриптомного анализа экспрессии генов следующих организмов: корова, собака, кошка, курица, макака-крабоед и макака резус, мартышка, лошадь, овца, свинья, люцерна, резуховидка, рис, соя, зебровая амадина, Данио-Рерио |
Источник излучения |
LED |
Длина волны возбуждения, нм |
530 |
Длина волны детекции, нм |
590 |
Разрешение, мкм |
1 |
Чувствительность |
0,1 флуорофор/мкм2 |
Емкость загрузчика |
стрип из 4-х микрочипов |
Время сканирования 4-х микрочипов, мин |
30 |
Цифровое разрешение |
12 bits |
Формат файлов |
dat |
Уровень шума |
<56 dB |
Операционная система |
Windows XP |
Габариты, мм |
226 х 437 х 348 |
Вес, кг |
11 |